FuzzyClustering 0.0.2

Fuzzy clustering algorithm toolbox

模糊聚类算法工具箱(python)

introduce

本开源项目为模糊聚类算法python代码，主要算法包括：

• FCM（模糊C均值算法）
• MEC （极大熵模糊聚类算法）
• KFCM（核模糊聚类算法）
• SFCM （半监督模糊聚类算法）
• eSFCM （基于信息熵的半监督模糊聚类算法）
• SMUC （基于度量学习与信息熵的半监督模糊聚类算法）

以这些算法为基础的相关论文可参考本人的谷歌学术主页：Wei Cai，Guangdong University of Technology

install

以下两种版本安装一个即可

• 安装正式版（推荐，但可能暂未发布）

  pip install FuzzyClustering
  

• 安装开发版（此版本并不稳定）

  py -m pip install --index-url https://test.pypi.org/simple/ --no-deps FuzzyClustering
  

project structure

• dataset：数据集
• ClusterAidedComputing.py ：包括聚类常用的一些函数
• ClusteringIteration.py ：包括聚类算法迭代式
• FuzzyClustering.py ：模糊聚类算法
• demo.py ： 演示脚本（运行此程序）

算法都封装在FuzzyClustering.py里，FuzzyClustering.py调用ClusterAidedComputing.py和ClusteringIteration.py

算法调用

参数

（以下为所有模糊聚类算法都有的参数）

data ：数据集，统一使用数组（darry）

cluster_n ：类簇中心数

max_iter ：最大迭代次数

e ：目标函数值变化最小阈值

printOn ：打印迭代情况开关（当printOn=1时打印迭代情况）

调用规则

所有的函数都需要输入data和cluster_n，其余参数可能有预设参数（若有预设参数则可以不输入，不输入则采用默认参数）

算法函数

• FCM

U,V,obj_fcn = fcm(data,cluster_n,m = 2,max_iter = 1000,e = 0.00001,printOn = 1)

或

U,V,obj_fcn = fcm(data,cluster_n)

如上，m ,max_iter,e ,printOn这四个参数已有默认参数，可不设置

• MEC

U,V,obj_fcn = mec(data,cluster_n,gamma=0.01,max_iter = 1000,e = 0.00001,printOn = 1)

gamma ：惩罚系数

• KFCM

  sigma ：高斯核标准差

  lamda ：惩罚系数

kfcm(data,cluster_n,sigma=2,m=2,lamda=0.1,max_iter = 1000,e = 0.00001,printOn = 1)

• SFCM

U,V,obj_fcn = sfcm(data,cluster_n,label,m = 2,max_iter = 1000,e = 0.00001,alpha=5,printOn = 1)

label ：标签（array格式）

• eSFCM

U,V,obj_fcn = esfcm(data,cluster_n,label,max_iter = 1000,e = 0.00001,lamda=1,printOn = 1)

• SMUC

U,V,obj_fcn = smuc(data,cluster_n,label,max_iter = 1000,e = 0.5,lamda=1,printOn = 1)

demo

import FuzzyClustering
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.metrics import accuracy_score


'''数据及参数设置'''
data_route = r'dataset\iris.csv'
label_route = r'dataset\irislabel.csv'

with open(data_route,encoding = 'utf-8') as f:
    data = np.loadtxt(f,delimiter = ",")
with open(label_route,encoding = 'utf-8') as f:
    label = np.loadtxt(f,delimiter = ",")

cluster_n = int(np.max(label))
data = ( data - np.min(data,axis=0)) / (np.max(data,axis=0) - np.min(data,axis=0))  #数据标准化

'''模糊聚类算法'''
U,center,fcm_obj_fcn = FuzzyClustering.smuc(data,cluster_n,label[1:20],max_iter = 100,e = 0.00001,lamda=0.5,printOn = 1)
label_pred,abaaba = np.where(U==np.max(U,axis=0)) #最大值索引

'''画图'''
plt.plot(fcm_obj_fcn)
plt.show()

'''性能评价'''
label_pred = label_pred + 1     #因为索引是从零开始，但标签是从1开始
print(U[:,1])
print("准确率：",accuracy_score(label.tolist(),label_pred.tolist()))

迭代目标函数值变化图：