BioPortal APIs

BioPortal APIs es un paquete de Python que permite accesar las bases de datos públicas del BioPortal del Departamento de Salud de Puerto Rico.

Este paquete le permite a uno descargar y guardar datos públicos del BioPortal a cualquier momento. Presenta un formato sencillo para facilitar su uso a cualquiera que lo desee.

Prerequisitos

Antes de comenzar, asegúrese de haber cumplido los siguientes requisitos:

• Tienes instalado una versión de Python >= 3.6
• Estas utilizando una computadora con Windows, Mac, o Linux.

Instalando BioPortal APIs

Para instalar BioPortal APIs, abre una ventana del Command Line o Terminal y corra:

pip install bioportal

Usando BioPortal APIs

Siga estos pasos en un programa de Python para descargar datos de APIs públicos:

from bioportal import BioPortalClient

cliente = BioPortalClient()

casos_por_coleccion = cliente.descargar_dataset('Casos por fecha de coleccion')
casos_por_coleccion.to_csv('Casos_por_fecha_coleccion.csv')

El resultado será un archivo conteniendo una tabla en formato csv. Además, puede ver cuales APIs estan disponibles usando:

cliente.datasets_disponibles()

Bases de datos disponibles:
  1   'Cantidades totales de pruebas reportadas'
  2   'Pruebas unicas con informacion minima'
  3   'Pruebas unicas con ID de paciente y fechas en tiempo local de Puerto Rico'
  4   'Pruebas unicas con ID de paciente y fechas en tiempo internacional UTC'
  5   'Pruebas diarias para grafica de dashboard de Salud'
  6   'Pruebas por fecha de coleccion'
  7   'Pruebas por fecha de reporte'
  8   'Pruebas por fecha de coleccion y entidad'
  9   'Total de TDF por fecha reportada de llegada'
 10   'Total de TDF por municipio'
 11   'Casos por fecha de coleccion'
 12   'Casos por fecha de creacion en sistema'
 13   'Casos por grupo de edad'
 14   'Casos por ciudad'
 15   'Casos por region'
 16   'Resumen de Escuelas Publicas y Privadas'

Nota: Si algun API esta bajo mantenimiento y/o desconectado, este paquete debería advertir sobre cual error en particular esta ocurriendo. Levante un "Issue" en este repositorio o contactenos incluyendo algun screenshot y descripción de como llego al error si encuentra algo extraño.

Contribuyendo a desarrollar este programa

Para contribuir al crecimiento de BioPortal APIs, sigue estos pasos:

1. Bifurca este repositorio.
2. Crea una rama: git checkout -b <nombre_rama>.
3. Haga sus cambios y guardelos usando un commit: git commit -m '<commit_message>'
4. Empujalos a la rama original: git push origin bioportal-apis/<localizacion>
5. Crea un pull request.

Alternativamente, puede rebuscar la documentación de GitHub para crear un pull request.

Contribuyentes

Contacto

En caso de alguna pregunta, puede contactarnos a través de jose.zavala@salud.pr.gov.

Licencia

Este proyecto esta licenciado bajo los terminos de la Licencia MIT.