Tools for camphor
Project description
camptools
camphor用ツール
インストール
pip install camptools
コマンド一覧
$ nmyqsub <job file> -m <message> -d <directory>
jobを投入し、job情報を記録する(job_status.sh, joblist.shなどに使用)
directoryを指定した場合、指定ディレクトリに移動後にqsubを実行
$ myqsub <job file> -m <message> -d <directory>
jobを投入し、job情報を記録する(job_status.sh, joblist.shなどに使用)
directoryを指定した場合、指定ディレクトリに移動後にqsubを実行
投入されるjobファイルは、パラメータファイルplasma.inpに応じてノード数を決定し置換したもの
python環境にf90nmlが必要
<job file>の形式は以下のようにすること
1. #QSUB -A p={}:t=1:c=64:m=90G
2. aprun -n {} -d 1 -N 64 ./mpiemses3D plasma.inp
$ job_status
jobの状態と標準出力の一部を出力
$ joblist
jobの状態を出力
$ jobhistory -n <num outputs> --correct_date
過去のjobのリストを表示
<job id>, <directory>, <message>, <date>
--correct_date:
*.o*ファイルから日付を読み取りjobに日付情報を付加する
(この日付情報は保存されるため毎回呼ばなくても良い)
$ extentsim <from-dir> <to-dir> --run
EMSESの継続シミュレーションを行う
from-dirに存在するmpiemses3D, job.sh, SNAPSHOT1, generate_xdmf.pyをto-dirにコピーする
runフラグを指定するとmyqsubによるジョブの投入まで行う
$ mymkdir --key <key> <directory>
keyで指定した構成のディレクトリを作成する
ディレクトリ構成の設定は~/copylist.jsonに記載する
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camptools-0.5.0-py3-none-any.whl
(10.6 kB
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Hashes for camptools-0.5.0-py3-none-any.whl
Algorithm | Hash digest | |
---|---|---|
SHA256 | 33a5ba8f56d4b348983ba6346d6cd3ad5519f8b030e0d9853fe70ea00c3ad596 |
|
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