colorbm 1.0.1

Color Beyond Matplotlib

colorbm

Color Beyond Matplotlib：提供matplotlib之外的色彩图（colormap）以及色板（color palette），仅此而已。

主要用于使用matplotlib进行科技论文配图的绘制。 colorbm提供三类色彩图或色板（colormap包含diverging和sequential两类）：

1. diverging 色彩图：此类色彩图适合绘制需要突出数值正负区别的图片，或者数值大小之间有明显的分界线
2. sequential 色彩图：此类色彩图具有连续的色彩变化，适合绘制数值连续变化（Continuous Data）的图片
3. palettes 色板：顾名思义，色板是不同颜色的集合，适合绘制分类数据（Categorical Data）以及离散数据（Discrete Data）

所有彩色图以及色板均从网络收集，包括或不仅限于以下图集：

• ggsci ：官网
• seaborn ：官网
• cmocean ：官网
• scientific ：官网
• CMasher ：官网
• CARTO ：官网
• Material Design ：官网

版本变动

20200923：

• 增加了色彩图
• 增加了显示测试图片的功能
• 可以输出色彩图以及色板的名称

20200922：增加来自世界名画 的色板以及《经济学人》杂志色板

使用说明

色板的使用

将所选择色板赋值于matplotlib中cmap参数即可

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import colorbm as cbm

plt.rcParams['scatter.edgecolors'] = 000000

np.random.seed(19680801)
N = 50
x = np.random.rand(N)
y = np.random.rand(N)

fig, ax = plt.subplots()
colors = np.random.rand(N)
area = (30 * np.random.rand(N)) ** 2  # 0 to 15 point radii

ax.scatter(x, y, s=area, c=colors, alpha=0.5, cmap=cbm.npg)
plt.show()

此外，也可将颜色的hex列表用于seaborn中

import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
import colorbm as cbm

sns.set_palette(sns.color_palette(cbm.hex_nejm))

# Load the penguins dataset
penguins = sns.load_dataset("penguins")

# Plot sepal width as a function of sepal_length across days
g = sns.lmplot(
    data=penguins,
    x="bill_length_mm", y="bill_depth_mm", hue="species",
    height=5
)

plt.show()

色彩图的使用

使用 cbm.seq('burg').as_cmap 获得连续色彩图； 使用 cbm.div('vlag').as_cmap 获得离散色彩图； 使用cbm.seq('burg').as_cmap_r 可以翻转色彩图

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import colorbm as cbm

X = np.arange(-5, 5, 0.25)
Y = np.arange(-5, 5, 0.25)
X, Y = np.meshgrid(X, Y)
R = np.sqrt(X**2 + Y**2)
Z = np.sin(R)

fig = plt.figure()
ax = Axes3D(fig)
ax.plot_surface(X, Y, Z, rstride=1, cstride=1, cmap=cbm.seq('ocean').as_cmap)

plt.show()

包含的色彩图以及色板

色彩图

seaborn

CARTO

cmoceam

scientific

CMasher

Material Design

色板

CARTO

• antique
• bold
• pastel
• prism
• safe
• vivid

ggsci

具体颜色可查询ggsci网站

• npg：自然出版集团出版杂志所用色板（Nature系列杂志）
• aaas：美国科学促进会出版杂志所用色板（Science系列杂志）
• nejm: 新英格兰医学杂志所用色板
• lancet：柳叶刀杂志所用色板
• jama：美国医学会杂志所用色板
• jco: 临床肿瘤学杂志所用色板
• ucscgb: 基因组浏览器用于染色体可视化的色板
• d3: JavaScript程序库D3.js所用色板，有四个分类： d3_10、d3_20、d3_20b以及 d3_20c
• locuszoom: LocusZoom图所用色板
• igv：IGV软件所用色板，有两个分类可用：igv以及igv_alternative
• uchicago: 芝加哥大学所用色板，有三个分类可用：uchicago、uchicago_light以及uchicago_dark
• startrek: 《星际迷航》系列影片所用色板
• tron: 《创：战纪》影片所用色板，其背景颜色较暗
• futurama: 《飞出个未来》电视剧所用色板
• rickandmorty: 《瑞克和莫蒂》电视剧所用色板
• simpsons: 《辛普森一家》电视剧所用色板
• gsea: GSEA分析所用色板
• economist: 经济学人杂志所用色板，有三个分类：economist、economist_primary以及economist_alternative

paintings

具体颜色可查询网站

• starrynight：来自梵高的名画《星夜》
• monalisa：来自达芬奇的名画《蒙娜丽莎》
• scream：来自蒙克的名画《呐喊》
• lastsupper：来自达芬奇的名画《最后的晚餐》
• afternoon：来自修拉的名画《大碗岛的星期天下午》
• optometrist：来自洛克威尔的名画《验光师》
• kanagawa：来自葛饰北斋的名画《神奈川冲浪里》
• kiss：来自克里姆特的名画《吻》
• memory：来自达利的名画《《持续的记忆》
• lilies：来自莫奈的名画《睡莲》

misc

包含以下色板

• economist
• economist_primary
• economist_alternative