Skip to main content

Tool for converting DICOM images to the BIDS/MIDS structure

Project description

dcm2mids

dcm2mids es una herramienta para convertir imágenes DICOM a la estructura BIDS/MIDS. Este proyecto ha sido creado utilizando PyScaffold.

Instalación

Installation

There are three options:

  • Clone the repository and add the folder to the PYTHONPATH (recommended if you wish to contribute, or develop on top of the existing methods):
git clone https://github.com/BIMCV-CSUSP/dcm2mids.git
export PYTHONPATH="<PATH>/dcm2mids:$PYTHONPATH"

Replacing <PATH> with the proper value to generate a global path to the dcm2mids folder. The configuration of the PYTHONPATH may vary for your system.

  • Clone the repository, and install from source as a pip package:
git clone https://github.com/BIMCV-CSUSP/dcm2mids.git
cd dcm2mids
pip install -e .
  • Install as a standalone pip package using:
pip install git+https://github.com/BIMCV-CSUSP/dcm2mids.git#egg=dcm2mids

Uso

Después de la instalación, puedes usar dcm2mids desde la línea de comandos. Aquí hay un ejemplo básico de cómo usar la herramienta:

dcm2mids /ruta/a/tu/archivo.dcm /ruta/de/salida

Desarrollo

Si deseas contribuir al desarrollo de dcm2mids, sigue estos pasos:

  1. Clona el repositorio:

    git clone https://github.com/tu-usuario/dcm2mids.git
    cd dcm2mids
    
  2. Crea un entorno virtual (opcional pero recomendado):

    python -m venv venv
    source venv/bin/activate  # En Windows usa `venv\Scripts\activate`
    
  3. Instala las dependencias para el desarrollo:

    pip install -U pip setuptools wheel
    pip install -e .[dev]
    
  4. Realiza tus cambios y asegúrate de que los tests pasen:

    pytest
    
  5. Realiza un pull request con tus cambios.

Licencia

Este proyecto está licenciado bajo los términos de la licencia MIT. Ver el archivo LICENSE para más detalles.

Contacto

Para preguntas o comentarios sobre dcm2mids, puedes abrir un issue en el repositorio o contactar a los mantenedores del proyecto.


Este `README.md` incluye instrucciones para la instalación, uso y desarrollo del proyecto `dcm2mids`, así como información sobre la licencia y el contacto para soporte adicional. Asegúrate de reemplazar `https://github.com/tu-usuario/dcm2mids.git` con la URL real de tu repositorio de GitHub.

Project details


Download files

Download the file for your platform. If you're not sure which to choose, learn more about installing packages.

Source Distribution

dcm2mids-0.1.3072024.tar.gz (43.4 kB view details)

Uploaded Source

Built Distribution

dcm2mids-0.1.3072024-py3-none-any.whl (34.7 kB view details)

Uploaded Python 3

File details

Details for the file dcm2mids-0.1.3072024.tar.gz.

File metadata

  • Download URL: dcm2mids-0.1.3072024.tar.gz
  • Upload date:
  • Size: 43.4 kB
  • Tags: Source
  • Uploaded using Trusted Publishing? No
  • Uploaded via: twine/5.1.1 CPython/3.8.5

File hashes

Hashes for dcm2mids-0.1.3072024.tar.gz
Algorithm Hash digest
SHA256 158aca0ed27c02c791d4a82cdfca0b9b186c3f565c5e0473c9eb35ec85adac0b
MD5 f9fdf37e7f0a61ffcf2ebfbf2b25d488
BLAKE2b-256 c741f0afa9f37ae10d5018597e871dac7e7aaf3a59c9ba706a410833b69844e8

See more details on using hashes here.

File details

Details for the file dcm2mids-0.1.3072024-py3-none-any.whl.

File metadata

File hashes

Hashes for dcm2mids-0.1.3072024-py3-none-any.whl
Algorithm Hash digest
SHA256 ebd018037d8003e8ea25815513fe1b7e9947e7fa2c4764413107caec1b97cdaf
MD5 c9babe2d93c5a35e25f9c404c57e5e34
BLAKE2b-256 e673373c39d41eb86cf9747fdbb5a32881b7a3d1157b9767bf5b0e2c245cf70f

See more details on using hashes here.

Supported by

AWS AWS Cloud computing and Security Sponsor Datadog Datadog Monitoring Fastly Fastly CDN Google Google Download Analytics Microsoft Microsoft PSF Sponsor Pingdom Pingdom Monitoring Sentry Sentry Error logging StatusPage StatusPage Status page