disease 0.1.9

Disease processing tool kit in Russian

Классификатор заболеваний

Patient-intake - модуль, обеспечивающий дистанционное взаимодействие пациента и медицинского учреждения с помощью диалоговых агентов. Реализован на языке Python.

Модуль позволяет предсказывать возможное заболевание пациента на основе введенной им информации, присваивать диагнозу степень срочности приема, а также выводить интерпретацию результатов работы модели. Для обучения модели создан датасет, содержащий информацию о болезнях и их симптомах.

Модуль поддерживает анализ текстов на русском языке.

Применение

Модуль является инструментом для разработки медицинских чат-ботов. Может быть использован для управления потоками пациентов в медицинских учреждениях, а также будет полезен для реализации концепции второго мнения при взаимодействии с пациентом.

Установка модуля

pip install distool

Пример использования

from distool.feature_extraction import SmartSymptomExtractor
from distool.interpretation.explainer import SymptomBasedExplainer
from distool.estimators import DiseaseClassifier

texts = [
    "У меня болит живот, но нет температуры",
    "У меня температура, но нет недомогания",
    "Я завтра иду домой",
]
diseases = ["гастрит", "отит", "-1"]

symptom_vectorizer = SmartSymptomExtractor()
features = symptom_vectorizer.transform(texts)

classifier = DiseaseClassifier()
classifier.fit(features, diseases)
predicted_diseases = classifier.predict(features)
print("Predicted diseases:", predicted_diseases)
# Predicted diseases: ['гастрит' 'отит' '-1']

explainer = SymptomBasedExplainer(symptom_vectorizer, classifier)

print(explainer.explain(features[1]))
# Наблюдается отит с вероятностью 59%.
# Это потому что у вас наблюдаются следующие симптомы: температура
# И отрицаются следующие: недомогание

Разработка

Нужно установить зависимости и подключить pre-commit.g

pip install -r requirements.py
pre-commit install
bash init.sh

Контрибьютинг

Каждый новый функционал должен покрываться документацией и тестом.

Тестирование

Чтобы запустить тесты нужно ввести:

pytest

Pull request

Каждый PR должен быть отревьювен.

История проекта

Работа над Patient-intake проводится в рамках НИР Университета ИТМО №622275 "Разработка модуля для предварительного диагноза: поддержание логистики потоков пациентов и концепции второго мнения при взаимодействии с пациентом через диалоговые системы" (2022-2023)

Участники проекта

Анна Чижик
руководитель проекта

Мичил Егоров
тимлид

Дмитрий погребной
разработчик

Айталина Кривошапкина
разработчик

Мария Якубова
аналитик

Обратная связь

Если у Вас есть какие-то вопросы, можете обращаться к нам по адресу: [e-mail]