Hydrogen adder for pdb protein files
Project description
Hadder--专用蛋白质补氢工具
很多蛋白质数据库往往会采用去掉氢原子的方式来存储各种pdb蛋白质结构文件, 这就要求我们在实际构建力场的过程中手动去补齐氢原子, 本开源工具就可以实现这样的功能。
示例
在examples
路径下有一个case2.pdb
的文件,这是一个不含氢原子的蛋白质,其结构如下图所示:
使用Hadder
完成补氢的操作之后,得到的结果如下图所示:
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Source Distribution
hadder-1.0.tar.gz
(12.8 kB
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Built Distributions
hadder-1.0-py3.9.egg
(16.9 kB
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hadder-1.0-py3-none-any.whl
(12.4 kB
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