Ziekteverspreiding gevisualiseerd
Project description
PlaguePY
Repository
Deze repository bevat alle code, documentatie en de applicatie van het IPASS-project.
Alle code bevind zich in plaguepy/
. Dit is de libary.
De code maakt gebruik van en genereerd data in data/
.
De applicatie waarmee de functionaliteit aan de hand van verschillende
casussen wordt getoont is te vinden in app.ipynb
.
Documentatie
De documentatie is te vinden in iedere functie. Tevens zijn er HTML-pagina's
gegenereerd, deze zijn te vinden in docs/build/html/index.html
. Via ReadTheDocs.io is de
laatste versie van de documentatie te zien via deze link.
De documentatie kan worden bijgewerkt met make html
. Tevens kan de documentatie in
EPUB- of LaTeX-vorm worden gegenereerd met make epub
resp. make latex
.
Installatie
De libary is te installeren via Pypi met pip: pip install plaguepy
.
Vervolgens kan de repository worden geimporteerd als plaguepy
.
De benodigde libary's zijn te vinden in requirements.txt
en te installeren met:
pip install -r requirements.txt
.
Het is aanbevolen om met een Anaconda omgeving te werken zodat de GEOS
uitbreiding
in C goed wordt geinstalleerd. Deze komt standaard met Anaconda wanneer cartopy wordt geinstalleerd.
Om de code te testen kan het commando pytest
worden uitgevoerd. Helaas zijn plots niet te testen.
© Thijs van den Berg 2019
1740697
Bronnen:
Malhotra, R., Dey, D., van Doorn, E. A., & Koonen, A. M. J. (2000). Traffic modeling in a reconfigurable broadband nomadic computing environment. In Proceedings of SPIE Vol. 4211: Internet, Performance and Control of Network Systems. Boston.
Dobrin, A. (2002). A REVIEW OF PROPERTIES AND VARIATIONS OF VORONOI DIAGRAMS. Whitman. Geraadpleegd van https://www.whitman.edu/Documents/Academics/Mathematics/dobrinat.pdf
van den Berg, T. (2009). Denbergvanthijs/AC-opdrachten. Geraadpleegd 24 juni 2019, van https://github.com/Denbergvanthijs/AC-opdrachten
9.2. math — Mathematical functions — Python 2.7.16 documentation. (z.d.). Geraadpleegd 17 juni 2019, van https://docs.python.org/2/library/math.html
Distributiekasten lichtnet Den Haag | Data overheid. (2017). Geraadpleegd 22 juni 2019, van https://data.overheid.nl/dataset/47539-distributiekasten-lichtnet-den-haag
Hondenpoepbakken Tilburg | Data overheid. (2017). Geraadpleegd 22 juni 2019, van https://data.overheid.nl/dataset/58437-hondenpoepbakken-tilburg
How to get the filename without the extension from a path in Python? (2009, 24 maart). Geraadpleegd 24 juni 2019, van https://stackoverflow.com/questions/678236/how-to-get-the-filename-without-the-extension-from-a-path-in-python
mplot3d tutorial — Matplotlib 2.0.1 documentation. (2017). Geraadpleegd 21 juni 2019, van https://matplotlib.org/2.0.1/mpl_toolkits/mplot3d/tutorial.html
mplot3d tutorial — Matplotlib 2.0.2 documentation. (2017). Geraadpleegd 21 juni 2019, van https://matplotlib.org/mpl_toolkits/mplot3d/tutorial.html
scipy.spatial.Voronoi — SciPy v0.18.1 Reference Guide. (2016). Geraadpleegd 19 juni 2019, van https://docs.scipy.org/doc/scipy-0.18.1/reference/generated/scipy.spatial.Voronoi.html
Simulation of Infectious Disease Spread. (2019). Geraadpleegd 20 juni 2019, van http://apmonitor.com/wiki/index.php/Apps/MeaslesVirus
Structuring Your Project — The Hitchhiker’s Guide to Python. (2019). Geraadpleegd 27 juni 2019, van https://docs.python-guide.org/writing/structure/
WisFaq! (2009). Geraadpleegd 19 juni 2019, van https://www.wisfaq.nl/show3archive.asp?id=59864
Zorginstellingen Utrecht | Data overheid. (2017). Geraadpleegd 22 juni 2019, van https://data.overheid.nl/dataset/48412-zorginstellingen-utrecht
Project details
Release history Release notifications | RSS feed
Download files
Download the file for your platform. If you're not sure which to choose, learn more about installing packages.
Source Distribution
Built Distribution
Hashes for plaguepy-2019.7.2.2-py3-none-any.whl
Algorithm | Hash digest | |
---|---|---|
SHA256 | 889d4c009f9efc680c675c3157857fdc50c17b6739ea6a4c809ac923c8c6971c |
|
MD5 | 8f9382e7c9ba7d0a3cb10932d2c5cb4a |
|
BLAKE2b-256 | 0fc9f7a19d87157a367a4c2a18525f6fd6be50de93fd63ebae3c30de8bf3f9d5 |