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MLmetagenomics
#本程序由高端设计编写,需要引用或者有建议请联系邮箱1481407566@qq.com本程序数据源为4000多名健康与患者的混合宏基因组测序结果,样本体内的微生物数量已经换算成相对百分比,总和接近1,使用4种机器学习的分类方法,线性回归,神经网络,SVM,random forest 建立模型,对新样本预测其患病与否
suffixdg
1.本程序由高端设计编写,需要引用及任何改进意见请联系邮箱1481407566qq.com。2.DNA功能域是隐藏在DNA序列中具有特定功能的重要区域,通过多条DNA序列比对容易发现。3.DNA序列比对需要耗费大量的计算机算力,本程序依托分支界定的suffix算法,和个人精心设计的程序代码,意图提供有竞争力的运算速度解决DNA比对问题。
eulerdg
#本程序由高端设计编写,需要引用或者有建议请联系邮箱1481407566@qq.com#本程序模拟二代测序后的DNA碎片拼接过程,使用通常的暴风(brute force)算法耗费较多计算机算力#本程序使用欧拉回路算法加以个人改进,意图提供有竞争力的运算速度