Populy 0.5.1

Simulate forward time population genetics evolution with Python

Populy

Populy es un paquete de Python que permite llevar a cabo una simulación de tipo forward evolution. El paquete consta varios módulos con sus respectivas clases que permiten llevar a cabo la creación de 0 de una población, la evolucion de ésta y la obtención de tablas y gráficos del resultado de la evolución.

Instalación

Es posible acceder mediante github o con el instalador de paquetes pip.

pip install Populy

Uso

from populy.population import Population

# crea un objeto de la clase Population
pop = Population(size=1000, 
                ploidy=2)

# genera individuos en la población
pop.generateIndividuals()

# hace evolucionar a la Población
pop.evolvePop(gens=200)

Para una explicación más detallada consultar el cuaderno [Guía de uso](Guia de uso.ipynb)

Mybinder

Si quieres acceder a una serie de Jupyter notebooks orientadas a la iniciación a la programación interactiva y la simulación evolutiva pulsa el siguiente botón.

Licencia

MIT