MtbDb 0.0.1

MtbDb: Genomics Database Toolkit for Mycobacterium Tuberculosis.

MtbDb: Genomics Database Toolkit for Mycobacterium Tuberculosis

MtbDb是一个专门为结核分枝杆菌（Mycobacterium Tuberculosis）基因组分析设计的Python工具包，提供了结核菌基因组数据库的高效查询和分析功能。

功能特性

• 🧬 结核菌基因组数据库查询
• 📊 基因变异分析(TBVA)
• 🔍 基因表达分析(TBGEA)
• 📈 统计分析和可视化
• 🔗 支持多种数据格式

安装

从TestPyPI安装

pip install -i https://test.pypi.org/simple/ MtbDb

从源码安装

git clone https://github.com/16627517673/mtbdb.git
cd mtbdb
pip install -e .

系统要求

• Python >= 3.8
• 依赖包：intervaltree, numpy, pandas, scipy, statsmodels

快速开始

import mtbdb

# 基本使用示例
# TODO: 添加具体的使用示例

许可证

本项目采用 Apache License 2.0 许可证。详见 LICENSE 文件。

作者

HengyuZhou ([e-mail])

项目主页

https://github.com/16627517673/mtbdb