BGE 开放平台 SDK - Python 版
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BGE 开放平台 是一个跨越多级数据的（多）组学数据平台，开发者在获得用户授权后，将可以通过开放平台提供的 API 访问关联用户的（多）组学数据，甚至写入数据。
基于开放平台 API，开发者可避免重复开发采样、提取、测序和生信分析等繁复的流程，直接使用清洁的结构化数据。
开发者可以通过开放平台提供的 API 创建极具创意性的（多）组学应用，如：
- 包含药物代谢或药物服用建议的应用
- 包含体检数据和营养代谢基因的餐饮应用
- 包含肠道菌群数据和痛风相关基因的痛风管理应用
- 基于祖源成分的社交网络应用，等等
BGE 开放平台 API 基于 OAuth 2.0 开发，并使用 SSL/TLS 加密传输，确保用户数据正确无误地授权，并安全地传输到第三方应用，确保用户数据不会被未经授权的应用获得。
安装
推荐使用 pip 进行安装。
$ pip install -U bge-python-sdk
或者
$ make install
再或者
$ python setup.py install
SDK 文档
更加详细的 SDK 文档请查看 SDK Documents。
快速开始
BGE 开放平台支持 OAuth2 的两种模式，分别是用户授权模式、客户端模式。
详情请参考开放平台文档 https://api.bge.genomics.cn/doc 。
ENDPOINTS
BGE 开放平台提供了如下可用的 endpoint。
| endpoint | 解释 |
|---|---|
| https://api.bge.genomics.cn | 线上环境 主域名地址 |
| https://api.bge.omgut.com | 线上环境 副域名地址，主域名地址不可用时可替换此域名地址 |
授权码模式
from bgesdk import OAuth2, API
code = '???????' # 用户确认授权后平台返回的授权码
client_id = 'demo'
client_secret = 'demo'
redirect_uri = 'http://test.cn'
oauth2 = OAuth2(
client_id, client_secret,
endpoint='https://api.bge.genomics.cn', max_retries=3, timeout=16,
verbose=False)
token = oauth2.exchange_authorization_code(code, redirect_uri)
api = oauth2.get_api(token.access_token)
print(api.get_user())
api = API(token.access_token)
print(api.get_user())
客户端模式
from bgesdk import OAuth2, API
client_id = 'demo'
client_secret = 'demo'
oauth2 = OAuth2(
client_id, client_secret,
endpoint='https://api.bge.genomics.cn', max_retries=3, timeout=16,
verbose=False)
token = oauth2.get_credentials_token()
api = oauth2.get_api(token.access_token)
print(api.get_variants('E-B1243433', 'rs333'))
api = API(token.access_token)
print(api.get_variants('E-B1243433', 'rs333'))
Contributors
- xiangji1204's github
- leafcoder(leafcoder@gmail.com)'s github
1 maintainer
Release files for bge-python-sdk 1.0.0
For a detailed explanation of source distributions (sdists) and built distributions (wheels), please see the package formats documentation.
Source distribution (sdist)
| File | Size | Uploaded | |
|---|---|---|---|
| bge-python-sdk-1.0.0.tar.gz | 56.8 kB | Details |
Built distribution (wheel)
| File | Interpreter | ABI | Platform | Reset |
|---|---|---|---|---|
| bge_python_sdk-1.0.0-py3-none-any.whl | Python 3 | none | any | Details |
Total release size: 140.3 kB
Release files / bge-python-sdk-1.0.0.tar.gz
| Download URL | bge-python-sdk-1.0.0.tar.gz |
|---|---|
| Size | 56.8 kB |
| Tags | Source |
|
SHA-256 checksum How to use checksums |
c2b3080bdf18b4692425bc30f2baf03446f9f13966953d9f56c9b6f0976f2781
|
|
BLAKE2b-256 checksum How to use checksums |
06d30f92261c9eda1f3c5fde3a489723c6dc0b3a56e2688b0626664b06b30328
|
| Upload date | |
|
Uploaded using Trusted Publishing? What is trusted publishing? |
No |
| Uploaded via |
twine/5.1.1 CPython/3.8.12
|
Release files / bge_python_sdk-1.0.0-py3-none-any.whl
| Download URL | bge_python_sdk-1.0.0-py3-none-any.whl |
|---|---|
| Size | 83.5 kB |
| Tags | Python 3 |
|
SHA-256 checksum How to use checksums |
6e4351b17912c41cc19686fc61be4f5cb15b30da3a508da57e6bcba450090516
|
|
BLAKE2b-256 checksum How to use checksums |
17320aebb6ff56f6c3190b2810f78c581e797a257762e111e7ff957d3f2a0c02
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No |
| Uploaded via |
twine/5.1.1 CPython/3.8.12
|
