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Librería de Python para transformar corpus bibliográficos en redes bibliométricas reproducibles (co-citación, colaboración, co-ocurrencia).

Project description

bib2graph

De una búsqueda bibliográfica a redes de citación reproducibles — una biblioteca de literatura que curás vos, sin servidores ni planillas.

PyPI Python License: GPL-3.0 CI

bib2graph toma una ecuación de búsqueda (o un archivo .bib), arma un corpus de papers desde OpenAlex, te deja curarlo y lo proyecta a redes bibliométricas listas para analizar en Gephi, Python o donde quieras: acoplamiento bibliográfico, co-citación, co-autoría, colaboración institucional y co-ocurrencia de keywords.

El corpus persiste y crece entre sesiones, y el resultado es reproducible: mismo input, mismas redes.

⚠️ Alpha. Mientras la versión sea 0.x, la API puede cambiar entre releases menores. Úsalo para explorar y validar, no como dependencia estable de producción todavía.

Instalación

Recomendamos uv para gestionar el entorno:

uv add bib2graph

También funciona con pip:

pip install bib2graph

Sembrar desde archivos BibTeX necesita un extra: bib2graph[bibtex].

Quickstart

De una ecuación a un GraphML, sin escribir código:

b2g init mi-investigacion
cd mi-investigacion

b2g seed --equation '"unequal ecological exchange"' --max-results 50   # corpus desde OpenAlex
b2g build                                                              # construye las redes
b2g export --format graphml                                           # → redes en GraphML

Cada comando acepta --json para orquestarlo desde scripts o agentes. Lista completa de comandos: b2g --help.

Con Claude Code: pedile a Claude que lo use

La forma más simple de usar bib2graph es pedirle a Claude que lo use por vos. bib2graph trae una skill de Claude Code que entrevista tu pregunta de investigación y corre el ciclo completo (init → seed → chain → build → read) sin que escribas comandos:

pip install bib2graph
b2g skill add            # instala la skill en ~/.claude/skills/bib2graph/

Después, en Claude Code: "usá bib2graph para armar la red de citación de estos papers…". La skill viaja dentro del mismo paquete que el CLI, así que siempre está al día con tu versión de bib2graph. Usá --project para instalarla solo en el proyecto actual.

Desde Python

from pathlib import Path
from bib2graph import OpenAlexSource, DuckDBStore, Networks, GraphMLExporter

corpus = OpenAlexSource().seed('"unequal ecological exchange"').corpus
store = DuckDBStore(Path("biblioteca.duckdb"))
store.persist(corpus)

for red in Networks.quick(store.load()):
    GraphMLExporter().export(red.graph, red.metrics, out_dir=Path(f"redes/{red.spec.kind}"))

Qué hace

  • Siembra desde una ecuación de búsqueda (OpenAlex) o un archivo BibTeX.
  • Expande el corpus siguiendo citaciones, rankeando candidatos por estructura — sin IA.
  • Curás vos: aceptar/rechazar papers, filtros PRISMA, todo versionable en CSV.
  • 5 redes bibliométricas: acoplamiento, co-citación, co-autoría, instituciones, co-keywords.
  • Sub-redes temáticas filtrando por keyword.
  • Biblioteca persistente (DuckDB) que crece entre sesiones.
  • Reproducible: mismo corpus → mismas redes y comunidades (hash de contenido).
  • Dos interfaces: CLI scriptable (b2g, salida --json) y librería de Python.
  • Exporta a GraphML/CSV para Gephi, Cytoscape, networkx, etc.

Cómo se construye (y la IA)

bib2graph se desarrolla con la IA en el lazo: una persona plantea el problema, decide y aprueba cada cambio; modelos de IA implementan el código, los tests y la documentación bajo esa dirección. El producto en sí no usa IA generativa — el ranking del forrajeo es estructura bibliométrica determinista (acoplamiento, co-citación, centralidad), sin LLM ni embeddings, y la curación es 100% humana. El detalle está en AI_DISCLOSURE.md.

Documentación

Licencia

GPL-3.0-or-later — software libre con copyleft fuerte: cualquier derivado que se distribuya debe seguir siendo libre y de código abierto. Es deliberado: esta herramienta queda para la comunidad y no puede cerrarse en un producto propietario.

Copyright (C) 2026 Equipo bib2graph (complexluise).

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Algorithm Hash digest
SHA256 996938b05a864e4fc1010af5e7d279ec2dbc5b198577b80428b13e75f1cf7e1a
MD5 5a6e3b90e0e9094048a3238aca5570da
BLAKE2b-256 26d1f7a457e344eaa952778b26142aa37ff5f06f2470fb79659ff1abdb1b8311

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SHA256 96f412d8d2022ce3a02e5ee20edbac084c877b047f45086711a6d8d151ed6bbd
MD5 0962de6808c9a79ba739a71c4c996f0e
BLAKE2b-256 166bcf4c36e055e36dff3b0c33269d0f125f84d2cd17a73e1c58f6f63de41523

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