Skip to main content

Develop MCP Servers for automate the work processes of the Clinical Data Manager.

Project description

Clinical Data Management MCP Server

이 프로젝트는 Clinical Data Manager(CDM)의 업무 프로세스 자동화를 위한 통합 MCP(Model Context Protocol) 서버입니다. 엑셀 비교 엔진, 구글 캘린더 연동 등 다양한 도메인별 모듈을 하나의 서버 인터페이스(server.py)를 통해 제공하여 Gemini 에이전트가 CDM 업무를 지능적으로 수행할 수 있도록 돕습니다.

프로젝트 구조

MCPs/ ├── modules/ # 도메인별 핵심 로직 (Engines) │ ├── init.py │ ├── excel_compare.py # 엑셀 시트 및 DB Spec 비교 엔진 │ └── calendar_maker.py # 엑셀 타임라인 파싱 및 구글 캘린더 업로드용 CSV 생성 ├── server.py # 통합 MCP 서버 엔트리포인트 (Master Gateway) ├── pyproject.toml # 프로젝트 메타데이터 및 의존성 관리 (uv) └── README.md # 프로젝트 통합 가이드


시작하기

1. 환경 설정 (uv 사용)

이 프로젝트는 파이썬 3.13 및 고성능 패키지 관리자인 uv를 사용합니다. 별도의 파이썬 설치 없이 uv만으로 모든 환경을 구축할 수 있습니다.

의존성 설치 및 가상 환경(.venv) 생성

uv sync

2. Gemini CLI 서버 등록

Gemini CLI가 현재 프로젝트의 가상 환경을 정확히 인식하고 도구를 발견(Discovery)할 수 있도록 등록합니다. 프로젝트 루트에서 다음 명령어를 실행하세요.

cdm-server라는 식별자로 통합 서버 등록

gemini mcp add cdm-server "uv run server.py" --scope project

  • uv run server.py: 프로젝트 내 .venv를 자동으로 찾아 서버를 실행합니다.
  • --scope project: 설정 파일을 현재 폴더(.gemini/settings.json)에 생성하여 프로젝트 독립성을 유지합니다.

디버그용 Inspector 모드

uv run mcp dev server.py

서버 직접 실행

uv run server.py

3. 등록 확인

등록된 서버의 상태와 사용 가능한 도구 목록을 확인합니다.

CLI 명령어

gemini mcp list

또는 대화 중(Interactive Mode)

/mcp list


포함된 도구 (Tools)

Excel & DB Spec Engine (modules/excel_compare.py)

  • compare_excel_sheet: 두 엑셀 파일의 특정 시트를 비교하여 차이점(추가, 삭제, 수정)을 분석하고 리포트(comparison_result.xlsx)를 생성합니다. (PK 컬럼 지정 필요)
  • compare_db_spec: CDM 전용 DB Spec 양식 워크북 전체를 비교합니다. 헤더 위치를 자동으로 인식하며, Revision History 시트를 자동 업데이트합니다.

Calendar Maker (modules/calendar_maker.py)

  • make_google_calendar_csv: 엑셀(Timeline/Schedule)에서 추출한 주요 일정을 구글 캘린더 업로드용 CSV 형식으로 변환합니다. 변환된 파일은 구글 캘린더에서 '설정 > 가져오기/내보내기'를 통해 즉시 등록할 수 있습니다.

사용 예시

서버가 성공적으로 연결되면 Gemini CLI 대화창에서 다음과 같이 자연어로 요청할 수 있습니다:

"이전 버전 DB Spec이랑 이번 버전을 비교해서 차이점 리포트 만들어줘. 그리고 Timeline 시트에서 일정들을 추출해서 구글 캘린더 업로드용 CSV 파일로 만들어줘."


Project details


Download files

Download the file for your platform. If you're not sure which to choose, learn more about installing packages.

Source Distribution

cdm_mcp_server-0.1.0.tar.gz (7.5 kB view details)

Uploaded Source

Built Distribution

If you're not sure about the file name format, learn more about wheel file names.

cdm_mcp_server-0.1.0-py3-none-any.whl (9.5 kB view details)

Uploaded Python 3

File details

Details for the file cdm_mcp_server-0.1.0.tar.gz.

File metadata

  • Download URL: cdm_mcp_server-0.1.0.tar.gz
  • Upload date:
  • Size: 7.5 kB
  • Tags: Source
  • Uploaded using Trusted Publishing? No
  • Uploaded via: uv/0.8.4

File hashes

Hashes for cdm_mcp_server-0.1.0.tar.gz
Algorithm Hash digest
SHA256 e42ae7a36d11fa5f9a6477a8e698ee36415c6ee21db30b397fc02e59f5723999
MD5 f9411f276df421186a73826c2235ba22
BLAKE2b-256 8fc0250e0892d40bd40ec6eaa989894d18b63430c4c2c48e4a5587bc72ac35fc

See more details on using hashes here.

File details

Details for the file cdm_mcp_server-0.1.0-py3-none-any.whl.

File metadata

File hashes

Hashes for cdm_mcp_server-0.1.0-py3-none-any.whl
Algorithm Hash digest
SHA256 7955380e2d846a852ee2776745ef5bdda83bd9905942df41ee9e118089980315
MD5 bb33c372274df744d5977057fa9d9a77
BLAKE2b-256 89cbe77ed36138b5eb9474d7510b72fb6302b76a1074288afb617a8a3a99c917

See more details on using hashes here.

Supported by

AWS Cloud computing and Security Sponsor Datadog Monitoring Depot Continuous Integration Fastly CDN Google Download Analytics Pingdom Monitoring Sentry Error logging StatusPage Status page