cosmatch 0.1.4

No project description provided

Глубокий анализ астрономических каталогов

Установка

CosMatch доступен для установки с сайта PyPI.

Установка базовой версии:

pip install cosmatch

Некоторые модули не представлены в базовой версии, так как содержат в себе спецефические модели, которые по возможности можно установить отдельно.

Доступные для дополнительной установки модули:

• nway- добавляет модель для отождествления на основе байесовского подхода.

• torch - открывает доступ к некоторым моделям, построенным на основе нейронных сетей.

Дополнительные модули могут быть установлены через "[extension-name]". Пример:

pip install cosmatch[extension-name]

Описание

Пакет CosMatch позволяет обрабатывать астрономические каталоги на новом уровне. В пакете реализованные следующие модули:

• match - отождествление космических каталогов из разных спектральных диапазонов.

• classification - Классификация астрономических объектов (в разработке).

• search - Поиск редких объектов.

Также представлены несколько вспомогательных модулей:

• load - загрузка каталогов и другие взаимодействия с популярными астрономическими сервисами.

Модуль match

Быстрый старт

Получение обучающей и прогнозной выборки.

from cosmatch.load import CSC2, CatalogLoader
from cosmatch.utils import add_postfix_to_main_columns
from cosmatch.match import get_pairs_train, get_pairs_predict

# Загружаем два рентгеновских каталога: Chandra - вспомогательный, 4XMM - основной каталог, который хотим отождествить
csc = CSC2().load()
xmm = CatalogLoader('Tests/4XMM.pkl').load()

# Загружаем оптических соседей в 15 угловых секундах от обоих каталогов
ps_near_cxc = CatalogLoader('Tests/PS_near_CSC_2_fluxes.pkl').load()
ps_near_xmm = CatalogLoader('Tests/PS_near_XMM_2_fluxes.pkl').load()

# Изменяем названия колонок, и устанавливаем словарь attrs
add_postfix_to_main_columns(csc, 'csc', add_to_attrs=True)
add_postfix_to_main_columns(xmm, 'xmm', add_to_attrs=True)
add_postfix_to_main_columns(ps_near_cxc, 'ps', add_to_attrs=True)
add_postfix_to_main_columns(ps_near_xmm, 'ps', add_to_attrs=True)
xmm.attrs['poserr'] = 'poserr'

# Получаем обущающую выборку, и выборку для применения модели (получения пар отождествления)
data_train = get_pairs_train(ps_near_cxc, xmm, csc, max_distance=15)
data_predict = get_pairs_predict(ps_near_xmm, xmm)

Построение пайплайна обучения.

from cosmatch.match import Pipeline
from cosmatch.match.models import Catboost
from cosmatch.transforms import DistanceTransform, FluxesTransform
from cosmatch.transforms import NeighboursTransform, IgnoreTransform

transforms = [
NeighboursTransform(
    to_r98=True,
    to_distance=(5, 10, 15)),
FluxesTransform(
    fluxes=[('ps_flux_1', 'ps_flux_1_err'),
            ('ps_flux_2', 'ps_flux_2_err'),
            ('xmm_flux_1', 'xmm_flux_1_err'),
            ('xmm_flux_2', 'xmm_flux_2_err'),
            ('xmm_flux_3', 'xmm_flux_3_err'),
            ('xmm_flux_4', 'xmm_flux_4_err'),
            ('xmm_flux_5', 'xmm_flux_5_err'),
            ('xmm_flux_8', 'xmm_flux_8_err'),
            ('xmm_flux_9', 'xmm_flux_9_err')]),
IgnoreTransform(
    ['ps_flux_1', 'ps_flux_1_err',
    'ps_flux_2', 'ps_flux_2_err',
    'xmm_flux_1', 'xmm_flux_1_err',
    'xmm_flux_2', 'xmm_flux_2_err',
    'xmm_flux_3', 'xmm_flux_3_err',
    'xmm_flux_4', 'xmm_flux_4_err',
    'xmm_flux_5', 'xmm_flux_5_err',
    'xmm_flux_8', 'xmm_flux_8_err',
    'xmm_flux_9', 'xmm_flux_9_err']
)
]
pipeline = Pipeline(
    model=Catboost(),
    transforms=transforms,
    ignored_features=['ra_xmm', 'dec_xmm', 'ra_ps', 'dec_ps'])

Обучение модели и прогноз на всем каталоге

pipeline.fit(data_train)

result = pipeline.predict(data_predict)

Более подробно про различные модели, метрики, преобразования данных смотрите в jupiter notebooks в примерах.

Примеры использования инструмента

• Основное обучение модулю match notebook

Документация

Документация CosMatch доступна тут