DNAkit: A Comprehensive Toolkit for Efficient DNA Research
DNAKit 是什么？
DNAKit 是面向 DNA 序列的可复现 Python 工具包，定位类似“DNA 领域的 RDKit”。它覆盖标准化、文件与注释格式、基础操作、描述符、模式扫描、热力学、指纹、相似度、聚类与数据划分、综合评价、分子生物学模拟和可视化，并可选用 DNA 基础模型提取 rep 后进行 k-means 聚类等各种各样的操作。
安装与快速入门
安装当前版本：
pip install dnakit==0.1.1
如果需要参与开发，克隆仓库后通过 Conda 创建完整环境：
conda env create -f environment-dev.yml
conda activate dnakit-dev
随后可以阅读 Python 快速入门指南。
文档
完整文档位于 DNAKit 文档首页，所有功能模块可在 功能树总览 中查看，常见问题见 FAQ。
支持与社区
Github仓库：
如果有问题、意见或建议，可以先查看：
更新日志
详细版本更新记录请查看 CHANGELOG.md。
引用
DNAKit 的项目论文尚未发表。当前版本可引用为：
DNAKit contributors. DNAKit 0.1.1, 2026. https://github.com/mapengsen/DNAKit
正式论文发表后，此处将更新为论文引用信息。使用具体算法、数据库或可选后端时，还应引用其对应来源。
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- Size: 866.5 kB
- Tags: Source
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twine/7.0.0 CPython/3.10.20
File hashes
| Algorithm | Hash digest | |
|---|---|---|
| SHA256 |
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|
| MD5 |
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|
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| BLAKE2b-256 |
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|
File details
Details for the file dnakit-0.1.1-py3-none-any.whl.
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- Download URL: dnakit-0.1.1-py3-none-any.whl
- Upload date:
- Size: 625.5 kB
- Tags: Python 3
- Uploaded using Trusted Publishing? No
- Uploaded via:
twine/7.0.0 CPython/3.10.20
File hashes
| Algorithm | Hash digest | |
|---|---|---|
| SHA256 |
8faa66fff33a18e265745f39875a79c5e19b1a97ea3d3c913934e5f0fdb7054c
|
|
| MD5 |
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|
| BLAKE2b-256 |
6a97aa912692e3b36c49a46e0ca96e5f6b3d3af1a26930f3170c26c60174dd2b
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