Skip to main content

A Python tool for automating EDS/EDX heatmap generation from microscopy data

Project description

EDSMapPlotter

Open In Colab DOI License Release

EDSMapPlotter é uma ferramenta open-source para automatizar a geração de mapas a partir de dados brutos (CSV) de Espectroscopia de Energia Dispersiva (EDS/EDX).

O software converte matrizes numéricas (arquivos .csv exportados de microscópios SEM) em imagens de alta resolução (300 DPI) prontas para publicação científica.


🚀 Como Usar

Opção A: Executar na Nuvem (Google Colab)

Não requer instalação. Ideal para uso rápido ou em computadores sem Python configurado.

  1. Clique no selo "Open in Colab" acima.
  2. Faça upload dos seus CSVs.
  3. Baixe os mapas gerados automaticamente.

Opção B: Instalação via PyPI (Recomendado)

Instale diretamente do Python Package Index:

pip install edsmapplotter

Execute o programa:

edsmapplotter

Opção C: Instalação Local (Desenvolvedor)

Para usar a interface gráfica (GUI) com suporte a arrastar-e-soltar no Windows/Linux/Mac:

  1. Instale as dependências:

    pip install -r requirements.txt
    
  2. Execute o script:

    python EDSMapPlotter.py
    

Funcionalidades

Processamento em Lote: Arraste dezenas de arquivos CSV e converta todos de uma vez.

Detecção Automática de Elementos: O script lê o nome do arquivo (ex: Area1_Fe.csv) e nomeia o gráfico corretamente ("Fe").

Visualização: Suporte a múltiplos mapas de cores (Viridis, Inferno, Blues, Reds, etc.).

Alta Qualidade: Exportação fixa em 300 DPI.

Formato de Entrada

O software espera arquivos .csv contendo apenas a matriz de intensidades (sem cabeçalhos/headers de texto), que é o padrão de exportação de muitos softwares de microanálise.

Citação

Se utilizar esta ferramenta em sua pesquisa, por favor cite:

Dossi, F. (2025). EDSMapPlotter: A Python tool for EDS map visualization (Version v0.2.1) [Computer software]. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.17741072

Project details


Download files

Download the file for your platform. If you're not sure which to choose, learn more about installing packages.

Source Distribution

edsmapplotter-0.2.1.tar.gz (5.6 MB view details)

Uploaded Source

Built Distribution

If you're not sure about the file name format, learn more about wheel file names.

edsmapplotter-0.2.1-py3-none-any.whl (5.6 MB view details)

Uploaded Python 3

File details

Details for the file edsmapplotter-0.2.1.tar.gz.

File metadata

  • Download URL: edsmapplotter-0.2.1.tar.gz
  • Upload date:
  • Size: 5.6 MB
  • Tags: Source
  • Uploaded using Trusted Publishing? No
  • Uploaded via: twine/6.2.0 CPython/3.13.5

File hashes

Hashes for edsmapplotter-0.2.1.tar.gz
Algorithm Hash digest
SHA256 d4ae64ba9f1df7deb5f180e1c5942eb38b39d4ca6612336e8599d72b6823bce5
MD5 884f09bcda50196b5ab163f785db696b
BLAKE2b-256 1411735caa6e2e3f5ca1300537862e05cf711b8eb4ad56356f9b51ad2271db14

See more details on using hashes here.

File details

Details for the file edsmapplotter-0.2.1-py3-none-any.whl.

File metadata

  • Download URL: edsmapplotter-0.2.1-py3-none-any.whl
  • Upload date:
  • Size: 5.6 MB
  • Tags: Python 3
  • Uploaded using Trusted Publishing? No
  • Uploaded via: twine/6.2.0 CPython/3.13.5

File hashes

Hashes for edsmapplotter-0.2.1-py3-none-any.whl
Algorithm Hash digest
SHA256 e7a475010a9ac36a62233fe1849916e7cc4658d084f682ba46b9ce51fbf7d6a1
MD5 9c03b86b86be7743376006213fd02eb0
BLAKE2b-256 4726dbf86ae8dd1c7726aab3699c8119f523d7b3ae449febaebad8d9d65c8207

See more details on using hashes here.

Supported by

AWS Cloud computing and Security Sponsor Datadog Monitoring Depot Continuous Integration Fastly CDN Google Download Analytics Pingdom Monitoring Sentry Error logging StatusPage Status page