mosqGIS 2.0.0

Pipeline para la extracción de información de imágenes satelitales y datos de ovitrampas

mosqGIS

Descripción

mosqGIS es un pipeline automatizado diseñado para la extracción y análisis de información de imágenes satelitales y datos de ovitrampas en el contexto de estudios de densidad de mosquitos. Este proyecto tiene como objetivo facilitar la obtención de matrices de clasificación de suelos, matrices de atracción y matrices de densidad de mosquitos inicial a partir de datos satelitales, utilizando tecnologías modernas de programación y herramientas de procesamiento de imágenes.

Características

• Extracción de datos: Capacidad para descargar y procesar imágenes satelitales de Landsat 8.
• Clasificación de suelos: Generación de matrices de clasificación de suelos basadas en imágenes procesadas.
• Predicción de densidad de mosquitos: Análisis de datos de ovitrampas para determinar la densidad inicial de mosquitos.
• Automatización: Pipeline completamente automatizado para mejorar la eficiencia del flujo de trabajo.

Requisitos

• Python 3.x
• gdal
• requirements.txt

Instalación

Puedes instalar mosqGIS de las siguientes maneras:

Opción 1: Instalación desde PyPI

Instala el paquete utilizando pip:

pip install mosqgis

Opción 2: Instalación desde el código fuente

1. Clona el repositorio:

git clone https://github.com/justog220/mosqGIS.git
cd mosqGIS

2. Crear un entorno virtual e instalar las dependencias:

python -m venv venv
source venv/bin/activate  # En Windows usa `venv\Scripts\activate`
pip install -r requirements.txt

Uso

Opción 1: Ejecutando desde PyPI

Si instalaste mosqGIS desde PyPI, puedes ejecutar el pipeline con el siguiente comando:

mosqGIS --carpeta_recortadas <ruta_a_imagenes_recortadas> --carpeta_no_recortadas <ruta_a_imagenes_no_recortadas> --ruta_poligono <ruta_del_poligono> --ruta_datos_ovitrampas <ruta_de_datos_ovitrampas>

Opción 2: Ejecutando desde el repositorio

Si clonaste el repositorio, utiliza el siguiente comando:

python main.py --carpeta_recortadas <ruta_a_imagenes_recortadas> --carpeta_no_recortadas <ruta_a_imagenes_no_recortadas> --ruta_poligono <ruta_del_poligono> --ruta_datos_ovitrampas <ruta_de_datos_ovitrampas>

Parámetros

• --carpeta_recortadas: Carpeta para imágenes recortadas.
• --carpeta_no_recortadas: Carpeta para imágenes no recortadas.
• --ruta_poligono: Ruta del archivo de polígono.
• --ruta_datos_ovitrampas: Ruta del archivo de datos de ovitrampas.

Contribuciones

Las contribuciones son bienvenidas. Si deseas colaborar en este proyecto, sigue estos pasos:

1. Haz un fork del proyecto.
2. Crea una nueva rama para tus cambios (git checkout -b feature/nueva-funcionalidad).
3. Realiza tus cambios y haz un commit (git commit -m 'Agregando nueva funcionalidad').
4. Sube tus cambios (git push origin feature/nueva-funcionalidad).
5. Abre un Pull Request.