thinker

Sistema de investigación profunda con LLM: descompone una pregunta, recupera fuentes reales, extrae afirmaciones, evalúa la evidencia y redacta un informe trazable. Incluye una capa de pensamiento estructurado en pasos validados y herramientas de análisis estático de código.

Herramienta real, en desarrollo activo: funcional, verificada y con las limitaciones documentadas al final. Incluye modos demo offline (MockLLM, MockSearchAPI) como ayuda para probarla sin red ni API keys; con proveedores reales ejecuta investigación real. Todavía no se declara lista para producción.

Qué contiene

Módulo	Función
deep_research_system.py	Pipeline de investigación: descomposición, recuperación, extracción de claims, evaluación y reporte.
llm_providers.py	Proveedores LLM (OpenAI, OpenRouter, Kilo, DeepSeek, Ollama, Mock). Reintentos con backoff y caché en las rutas OpenAI-compatibles; Ollama y Mock no reintentan.
thinking_engine.py	Motor común de ciclos de pensamiento por pasos con validación antes de avanzar (sin duplicación) + Tree of Thoughts (BFS/DFS/Beam).
pensamiento_layer.py	Los 7 pasos de pensamiento para investigación + orquestador con pensamiento.
code_design_improvement_tools.py	Análisis estático de Python (AST) y ciclo de pensamiento para decisiones de diseño.
web_search.py	Búsqueda real sin API key (Wikipedia, DuckDuckGo) y mock offline, con formulación de consulta.
plugins/	Sistema de plugins con hot-swap (proveedores LLM y búsqueda, extensiones del núcleo) + CLI de gestión. Config: config/plugins.yaml; guía: docs/PLUGINS.md.
tests/benchmarks/	Framework de benchmark por dominio con rúbricas y LLM-as-judge opcional (--list para ver las tareas).
docs/LECCIONES-APRENDIDAS.md	Memoria del proyecto: hallazgos, causas y soluciones.
docs/RECOMENDACIONES-MEJORAS.md	Recomendaciones abiertas priorizadas, con evidencia, esfuerzo, riesgo y criterio de aceptación.
docs/REFERENCIAS-IA.md	Teoría y práctica de IA (referencias verificadas contra arXiv y guías de ingeniería) con propuestas medidas por el benchmark.
evaluar_proyecto.py	Evaluación estática y read-only de un proyecto externo en 6 dimensiones, con perfil de lenguajes/manifiestos/locks y criterios N/A que no se cuentan como fallos; declara cobertura y ratio. Evidencia por hallazgo ligada a su criterio, plan de mejora derivado de las métricas y, opt-in, síntesis del modelo con control anti-invención y dudas investigadas con fuentes. Incluye verificación opt-in de requisitos (--requisitos, ver docs/REQUISITOS.md). Informes: docs/EVALUACIONES.md.
AGENTS.md	Reglas de trabajo para agentes de IA (ruleset P0/P1/P2 + reglas propias).

Requisitos

• Requisitos
  • Python 3.11 o superior (verificado en 3.11/3.12 en Linux y en 3.12.7/3.14.3 en Windows 11).
  • Dependencias: requests, openai>=1.0,<4, python-dotenv, PyYAML (ver requirements.txt; el lock fija las exactas con hashes). openai verificado en 1.109.1, 2.54.0, 3.33.0, 3.35.1, 3.36.1 y 3.37.0 (lock en 3.37.0).
  • Opcional: Ollama para modelos locales.

Instalación

python3 -m venv .venv
source .venv/bin/activate        # Linux/macOS
# .venv\Scripts\Activate.ps1    # Windows PowerShell (usa `python`, no `python3`)

# Opción reproducible (versiones fijadas con hashes):
python3 -m pip install --require-hashes -r requirements.lock

# Opción rápida (rangos de versión):
pip install -r requirements.txt

En Windows, python3 no siempre existe o puede apuntar a otro intérprete; usa python (o la ruta explícita) y el activador de PowerShell/cmd.

Uso desde otros proyectos (paquete instalable)

El proyecto thinker se distribuye como el paquete pip thinker-research: otros proyectos pueden usarlo como librería o como herramienta de consola.

pip install .                                  # desde una copia del repo
pip install git+https://github.com/jmbigi/thinker.git   # directo del remoto
pip install git+https://github.com/jmbigi/thinker.git@v0.1.9   # tag fijado (verifica el remoto)
pip install thinker-research==0.1.9            # desde PyPI

La versión 0.1.9 es la release actual. La instalación por tag sigue disponible y no requiere PyPI ni claves. Estado de la publicación: docs/PUBLICACION.md.

Como herramienta de consola (evalúa y recomienda mejoras a OTRO proyecto, estática y read-only):

evaluate-project RUTA_DEL_PROYECTO --sin-red   # añade --ejecutar-tests (opt-in)

(Captura histórica y verbatim de una ejecución del evaluador anterior a v2 sobre un proyecto con defectos plantados — GLOBAL 0.344 y 19 propuestas; solo el ritmo de aparición del texto es presentación. El evaluador v2 añade perfil, cobertura y criterios N/A: ver docs/EVALUACIONES.md para las cifras actuales.)

El informe --json es un contrato versionado: incluye schema_version: 2 y los campos cobertura, global_nota, no_verificado y licencias_no_runtime (dependencias de desarrollo/opcionales, informativas y fuera del score h5). Un consumidor debe comprobar schema_version antes de asumir el resto del esquema.

Verificar una lista de requisitos

Además del rubric fijo, el evaluador puede contrastar requisitos declarados por ti contra el código y los tests:

evaluate-project RUTA --requisitos requisitos.md
evaluate-project RUTA --requisitos requisitos.md --ejecutar-tests

El archivo es Markdown estructurado (## ID: título + - Enunciado: + - Criterio de aceptación: + - Verificación: + - Evidencia:). Los veredictos son CUMPLE (suite verde), CUBIERTO (evidencia estática), NO CUMPLE y NO VERIFICABLE; el informe es aparte y no altera el GLOBAL. Formato completo, métodos y límites: docs/REQUISITOS.md.

Auditar cambios de agentes

El auditor de cambios revisa un diff y marca señales mecánicas de cambios no solicitados: rutas prohibidas, tests debilitados, cobertura rebajada, supresiones, dependencias nuevas, requisitos modificados y diff excesivo. No detecta intención ni autoría; es una capa de evidencia para revisión humana.

python3 scripts/audit_changes.py --staged
python3 scripts/audit_changes.py --base origin/main --json
make audit-diff BASE=origin/main

Reglas, veredictos y límites: docs/AUDITORIA-CAMBIOS.md.

Holdout independiente

holdout/ no se descubre con make test. El runner verifica el SHA-256 de cada test contra holdout/HASHES.json y después los ejecuta; si un test cambió sin actualizar el manifiesto, falla:

python3 scripts/run_holdout.py
make holdout

El hook pre-commit y make ci ejecutan auditor y holdout. Es tamper-evidence, no una protección criptográfica: el control real es ejecutarlo fuera del alcance de escritura del agente y revisar sus cambios.

Como librería (los módulos públicos quedan importables):

from evaluar_proyecto import evaluar            # evaluar un proyecto: dict completo
from pensamiento_layer import DeepResearchThinkingLayer
from deep_research_system import ResearchOrchestrator
from code_design_improvement_tools import CodeImprovementOrchestrator
from llm_providers import MockLLM               # + OpenRouterLLM, OllamaLLM...
from web_search import MockSearchAPI            # + Wikipedia/DuckDuckGo

Notas honestas: el registro de plugins usa rutas relativas por defecto (plugins/, config/plugins.yaml); desde otro proyecto pasa plugin_dirs y config_path explícitos a PluginRegistry. El paquete instalado scripts existe porque el evaluador importa scripts.preflight; tenlo en cuenta si tu proyecto ya instala un paquete con ese nombre. tests no se instala (un tests raíz en site-packages colisionaría con otros proyectos): el benchmark se ejecuta desde el repo con python3 -m tests.benchmarks.run_bench.

Uso rápido — modo demo offline (sin red ni API keys)

python3 deep_research_system.py            # pipeline completo (LLM y búsqueda simulados)
python3 pensamiento_layer.py               # ciclo de pensamiento de 7 pasos
python3 code_design_improvement_tools.py   # análisis estático + decisiones de diseño

Es el modo demo: una ayuda para probar y comprender el sistema. MockLLM y MockSearchAPI están declarados como simulados y no producen investigación real; con proveedores y buscadores reales (sección siguiente), sí.

Uso real (OpenRouter con modelos gratuitos)

1. Copia .env.example a .env y pon tu clave de OpenRouter: OPENROUTER_API_KEY=... (el archivo .env está en .gitignore).
2. Opcional: elige otro modelo gratuito con OPENROUTER_MODEL (por defecto poolside/laguna-xs-2.1:free, coste 0).
3. Ejecuta la verificación real de extremo a extremo:

python3 test_openrouter_real.py     # conexión + pensamiento + pipeline (modelo :free)
python3 test_env_usage.py --real    # integración de la clave .env
python3 openrouter_integration_demo.py --real

Con Ollama local (sin API key, sin coste; requiere ollama serve):

python3 test_ollama_real.py         # conexión + pensamiento + pipeline con LLM local
OLLAMA_MODEL=qwen3:8b python3 test_ollama_real.py   # otro modelo local

Para usar búsqueda web real en el pipeline:

from deep_research_system import OpenRouterLLM, ResearchOrchestrator
from web_search import WikipediaSearchAPI      # o DuckDuckGoSearchAPI

report, ctx = ResearchOrchestrator(OpenRouterLLM(), WikipediaSearchAPI()).research(
    "¿Cuál es el estado actual de la fusión nuclear?"
)

Verificación independiente (segunda pasada tipo CoVe) con proveedor SEPARADO del generador —la independencia se declara por claim en el contexto y en el decision_log (proveedor-distinto; sin verificador separado se ejecuta igual pero queda declarada como mismo-proveedor, nunca silenciosa):

report, ctx = ResearchOrchestrator(
    OpenRouterLLM(),                                  # generador y evaluador
    WikipediaSearchAPI(),
    verificacion_independiente=True,
    llm_verificador=OpenRouterLLM(model="otro-modelo:free"),  # verificador CoVe
).research("¿Cuál es el estado actual de la fusión nuclear?")

Modos piloto opt-in (desactivados por defecto; ver Hallazgo 76 en docs/LECCIONES-APRENDIDAS.md):

• congelar_fases=True en el motor de pensamiento: cada fase ejecutada se congela con su hash y las fases posteriores la reciben como INMUTABLE en el prompt (no aplica a ToT, y lo declara).
• muestras_consenso>1 en el pipeline: repite la evaluación de cada claim y marca discrepancia_muestreo si los veredictos divergen (señal de juicio inestable o alucinación); el coste extra queda declarado por claim. Benchmark offline: python3 tests/benchmarks/consenso_muestreo.py.

Verificación

make check                                    # lint + preflight + docs-check + tests + secretos + ci + hook
make lint                                     # ruff check .
make preflight                                # gates deterministas (imports, silencios, duplicados, tareas)
make test                                     # suite unittest (stdlib)
make coverage                                 # cobertura de los módulos de producción
make secrets                                  # escaneo de secretos/datos personales
make sbom                                     # inventario de dependencias (syft si está)
make vuln-scan                                # pip-audit sobre requirements.lock
make mutation                                 # pruebas de mutación (mutmut)
make ci                                       # CI local: verifica una copia limpia de HEAD
make lock                                     # regenera requirements.lock con hashes
make hook                                     # instala el hook pre-commit de git

Equivalente sin make:

ruff check .
python3 scripts/preflight.py                  # gates estáticos deterministas (AST, offline)
python3 scripts/check_docs.py                 # cifras de estado presente vs realidad
python3 -m unittest discover -s tests -v
python3 -m coverage run --source=. -m unittest discover -s tests && python3 -m coverage report -m
bash scripts/scan-secrets.sh
python3 honest_test.py                        # comprobación honesta del sistema
python3 evaluar_proyecto.py RUTA              # evaluación externa (6 dimensiones, read-only)
python3 evaluar_proyecto.py RUTA --requisitos requisitos.md   # requisitos (opt-in)
python3 scripts/audit_changes.py --base origin/main           # audita cambios de agentes
python3 scripts/run_holdout.py                # holdout (hashes + tests)
python3 scripts/probe_model.py --samples 5    # sonda de latencia del modelo (opt-in)

El hook .git/hooks/pre-commit (instalado con make hook) ejecuta ruff, el escaneo de secretos, py_compile, el preflight, docs-check, la suite, el auditor de cambios y el holdout antes de cada commit.

Limitaciones conocidas (sin adornos)

• El pipeline con MockSearchAPI no hace investigación real: las fuentes son ficticias. Con WikipediaSearchAPI/DuckDuckGoSearchAPI sí recupera fuentes reales, pero la calidad depende de esas fuentes.
• Los dos orquestadores (ResearchOrchestrator y ResearchOrchestratorWithThinking) usan el mismo pipeline real de evidencias; la calidad del informe depende del modelo y del buscador configurados, no de heurísticas locales.
• Los modelos gratuitos de OpenRouter tienen límites de tasa y errores 5xx transitorios; el código reintenta con backoff, pero la intermitencia persiste.
• No hay integración continua en la nube (la verificación es local, por diseño).
• Verificado en Linux (Python 3.11/3.12) y en Windows 11 (3.12.7/3.14.3, 750/750; última verificación Windows 2026-10-22); macOS no se ha probado. Los scripts bash/make se verificaron en Linux; en Windows se ejecutaron los comandos Python equivalentes.
• La suite mata el 95,2% de los mutantes de mutmut (3635/3819; 184 supervivientes, 0 timeouts, 0 sospechosos; medición 2026-10-23, re-medida el 2026-10-24 sin cambios, excluyendo las líneas print, que solo generan mutantes equivalentes): cobertura alta no equivale a tests fuertes. Mediciones anteriores: 94,7% (3581/3780), 94,7% (3570/3769), 94,1% (3567/3789), 79,8% (3022/3789), 79,9% (2863/3582) y 78,1% (2766/3543).

Licencia

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Reglas del proyecto

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