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anatomapa

anatomapa

Pinte o corpo humano com os seus dados.
De um dicionário ou de uma planilha a um mapa de calor anatômico em SVG, pronto pra publicar, em poucas linhas de Python e com zero dependências.

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PyPI Python 3.10+ License MIT zero dependencies

Mapa de calor anatômico masculino e feminino, com legenda


Sobre

anatomapa é uma biblioteca Python para gerar mapas de calor anatômicos da superfície externa do corpo humano. Você entrega dados quantitativos por região (frequência, intensidade ou densidade de eventos) e a lib devolve o corpo colorido, de frente e de costas, masculino ou feminino, com a cor proporcional ao valor de cada região.

Serve pra qualquer área que registra a região corporal como variável: acidentes com animais peçonhentos (escorpiões, serpentes, aranhas), traumas ocupacionais, lesões esportivas, medicina forense, queimaduras e dermatologia.

  • Zero dependências: só a stdlib do Python no núcleo; PNG/JPG é um extra opcional.
  • Determinística: a mesma entrada gera exatamente o mesmo SVG.
  • Bilíngue: entende nomes de região em PT-BR e EN e escreve rótulos nos dois idiomas.

Instalação

pip install anatomapa

Requer Python 3.10+ e nenhuma dependência externa.

Para gerar PNG/JPG/JPEG (saída raster), instale o extra opcional, que traz cairosvg e Pillow. O SVG puro não precisa disso.

pip install "anatomapa[raster]"

As aspas importam: shells como zsh e fish tratam os colchetes como glob, então use aspas.

Para desenvolvimento, clone o repositório: git clone https://github.com/pedrorcruzz/anatomapa.git

Início rápido

import anatomapa as am

fig = am.heatmap({"hand": 5153, "foot": 13666, "head": 845})
fig.save("mapa.svg")

Pronto: um SVG com mãos, pés e cabeça coloridos por valor. O resto deste manual é opcional.

Parâmetros de heatmap()

am.heatmap(values, view="anterior", body="male", lang="pt", format="svg",
           title=None, background="transparent", on_unknown="error",
           region_map=None, split=False)
Parâmetro Valores Padrão O que faz
values dict {região: valor} ou pares (região, valor) obrigatório Dados; chave pode ser Region; aceita a saída dos leitores
view "anterior", "posterior", "both" "anterior" Frente, costas, ou as duas lado a lado com uma legenda só
body "male", "female" "male" Corpo masculino ou feminino
lang "pt", "en" "pt" Idioma dos rótulos escritos no SVG
format "svg", "png", "jpg", "jpeg" "svg" Padrão quando o caminho salvo não tem extensão; png/jpg/jpeg pedem o extra raster
title str ou None None Opcional: só desenha o título se for informado
background "dark", "light", "transparent" "transparent" Fundo da figura
on_unknown "error", "skip", "warn" "error" O que fazer com nome não reconhecido
region_map dict {seu rótulo: id da região} None De-para de nomes seus; tem precedência
split True, False False Só com view="both": True devolve o par (frente, costas)

split só vale com view="both": False desenha as duas vistas lado a lado numa figura única com uma legenda; True devolve o par (anterior, posterior) de figuras independentes, cada uma com a própria legenda e a mesma escala de cor. Com outra view, levanta ValueError.

frente, costas = am.heatmap(dados, view="both", split=True)
frente.save("frente.png")
costas.save("costas.png")

Retorna um objeto Figure. Nome de região desconhecido levanta ResolutionError (exceção pública da lib). A paleta de cores é sempre a térmica (azul frio para laranja quente, visual de câmera térmica); não há escolha de paleta. A escala de intensidade é sempre linear: a cor cresce proporcional ao valor.

Fundo e título

  • background: "dark" (#0a0a0a), "light" (#ffffff) ou "transparent" (padrão, sem fundo). As cores da legenda se adaptam ao fundo escolhido.
  • title: quando informado, sai em negrito e centralizado numa faixa acima do desenho; o viewBox cresce só para cima, sem mudar a largura, a cor do texto acompanha o fundo e título longo encolhe a fonte para caber. Vale em qualquer view (com split=True, cada figura recebe o título) e segue também como <title> do SVG. None (padrão) não desenha nada nem reserva espaço.

A legenda (barra de valores mín..máx, rótulo conforme lang) e o degradê térmico sobre o corpo são nativos: sempre presentes, sem parâmetro. Ex.: am.heatmap(dados, background="dark").

Nomes de região

A identificação é estrita: vale o id da região escrito exatamente como definido, ou uma chave do seu region_map. Nada é adivinhado, então não existe uma segunda grafia certa para a mesma região. Nome desconhecido levanta ResolutionError, listando o que falhou e sugerindo o mais parecido. Controle com on_unknown: "error" (padrão), "skip" ou "warn".

No código: o enum Region. from anatomapa import Region traz 30 constantes: os 14 ids canônicos mais as versões _LEFT/_RIGHT das 8 bilaterais. Cada membro é a própria string do id (Region.TRUNK == "trunk"), então vale como chave de heatmap() ou valor de region_map. O ganho é autocomplete e typo virando erro imediato. list(Region) ou list_regions() listam.

Lateralidade. As bilaterais (braço, antebraço, mão, dedo, coxa, perna, pé, dedo do pé) aceitam lado pelo sufixo do id: Region.HAND_RIGHT pinta só a direita; sem sufixo (Region.HAND), o valor pinta os dois lados. Pedir lado em região central é erro.

Seus nomes vindos da planilha: region_map. Como os rótulos da sua fonte quase nunca batem com os ids, é você quem declara a correspondência, uma vez, no código. A chave é comparada exatamente como está na planilha, incluindo acento e caixa alta:

am.heatmap({Region.TRUNK: 50, Region.HAND_LEFT: 100})  # enum (ou "trunk"/"hand_left")
am.heatmap(dados, region_map={"MÃO": Region.HAND, "ANTE-BRAÇO": Region.FOREARM})

Regiões e hierarquia

São 15 regiões. trunk é um agregador hierárquico: sem geometria própria, só distribui valor para os filhos, que mudam conforme a vista, como em qualquer atlas de anatomia externa. As bilaterais aceitam sufixo _left/_right (ex.: hand_left); sem sufixo, pinta os dois lados.

Visão frontal (view="anterior", padrão)

head (cabeça) · chest (peito) · abdomen (abdômen) · pelvis (pelve) · arm (braço/ombro) · forearm (antebraço) · hand (mão) · finger (dedos da mão) · thigh (coxa) · leg (perna) · foot (pé) · toe (dedos do pé). O agregador trunk pinta chest + abdomen + pelvis.

Visão posterior (view="posterior")

head (cabeça) · back (dorso) · buttocks (nádegas) · arm (braço) · forearm (antebraço) · hand (mão) · finger (dedos da mão) · thigh (coxa) · leg (perna) · foot (pé) · toe (dedos do pé). O agregador trunk pinta back + buttocks.

buttocks e back são exclusivas da posterior; chest, abdomen e pelvis, da anterior; o resto vale nas duas. list_regions(view=...) filtra por vista.

Rollup (herança pai para filhos). Mande o dado no nível que você tiver:

am.heatmap({"trunk": 2602})                                # chest+abdomen+pelvis+back herdam
am.heatmap({"chest": 900, "abdomen": 1200, "pelvis": 500})  # ou por parte

Um valor no pai desce automaticamente pros filhos; se você informar a parte específica, ela usa o próprio valor. Mesma lógica em hand para finger e foot para toe.

Região sem dado. Região sem valor sai nativamente em cinza neutro (#9aa0a6), distinto do frio: "sem dado" não se confunde com "poucos casos". Sem parâmetro.

Entrada de dados

heatmap() aceita dict ou qualquer iterável de pares (região, valor), então a saída de todos os leitores vai direto, sem conversão:

# dict puro (ou normalizado via from_dict)
fig = am.heatmap(am.from_dict({"hand": 10, "foot": 25}))

# CSV: você declara as colunas, nada é adivinhado
dados = am.from_csv("lesoes.csv", region_col="regiao", value_col="total", delimiter=",")

# JSON: objeto {"hand": 10} ou lista [{"region": "...", "value": ...}]
dados = am.from_json("lesoes.json", region_key="region", value_key="value")

# Registros: dicts, namedtuples, dataclasses e DataFrame do pandas (duck typing)
dados = am.from_records(registros, region_col="regiao", value_col="total")

# Excel .xlsx, sem dependência externa; coluna por índice, letra "D" ou nome do cabeçalho
dados = am.from_xlsx("lesoes.xlsx", sheet="2024", region_col="Região",
                     value_col="Total", header=True)

No from_xlsx, aggregate resolve planilhas com uma linha por caso: "count" conta as ocorrências de cada região e "sum" soma os valores. None (padrão) espera uma linha por região.

Saída: o objeto Figure

Uso Resultado
fig.save("mapa.svg") grava o arquivo; a extensão do caminho (.svg, .png, .jpg) decide o formato, fig.save(caminho, format="png") força outro e, sem extensão, vale o format do heatmap
fig.to_svg() devolve o SVG como str
fig.to_png() devolve o PNG como bytes (pede anatomapa[raster])
fig.to_jpeg() devolve o JPEG como bytes (pede anatomapa[raster])
str(fig) idem to_svg(), SVG puro (útil em templates)
célula do Jupyter renderiza inline automaticamente

Pra saída raster (PNG/JPG/JPEG), instale o extra opcional pip install anatomapa[raster] (traz cairosvg e Pillow, importados só sob demanda; o núcleo segue zero dependências e o SVG puro nunca precisa de extra). Qualquer figura rasteriza certo: na hora de virar PNG/JPG ela usa uma variante sem os filtros SVG (que os conversores raster não implementam), gerada sob demanda, então am.heatmap(dados).save("mapa.png"), to_png(), to_jpeg() e format="png" produzem a mesma imagem, com as mesmas cores e o mesmo visual térmico. Sem o extra instalado, pedir png/jpg/jpeg levanta ImportError com a dica de instalação.

Exemplo completo

Topografia de picadas de escorpião (frequência por região), do dado bruto ao mapa final:

import anatomapa as am
from anatomapa import Region

dados = {Region.HEAD: 845, Region.ARM: 1831, Region.FOREARM: 974, Region.HAND: 5153,
         Region.FINGER: 8684, Region.TRUNK: 2602, Region.THIGH: 1733,
         Region.LEG: 1984, Region.FOOT: 13666, Region.TOE: 6547}

# 1. Confere os nomes antes de renderizar (dry-run, não gera nada)
resultado = am.validate(dados)
assert not resultado["unresolved"]

# 2. Gera o mapa: visual térmico em fundo escuro
fig = am.heatmap(dados, body="male", background="dark")
fig.save("mapa.svg")

Utilidades

validate(values, body="male", region_map=None) faz o dry-run: não renderiza, só mostra o que resolve e o que não.

am.validate({"hand": 1, "haand": 2, "hand_right": 3})
# {'resolved': {'hand': 'hand', 'hand_right': 'hand_right'},
#  'unresolved': {'haand': {'reason': 'região desconhecida',
#                           'suggestions': ['hand', 'head', 'hand_left']}}}

list_regions(lang="pt", body="male", view=None) lista as regiões, cada uma como {"id", "label", "bilateral", "parent", "views"}. Com view, filtra por vista:

am.list_regions(view="posterior")
# [{'id': 'head', ..., 'views': ['anterior', 'posterior']}, {'id': 'back', ...}, ...]

Galeria

Mãos com valores altos   Pernas e peito com valores altos Mesmo mapa em fundo escuro, claro e transparente, masculino e feminino Modelo anatômico masculino e feminino

Licença e atribuição

Distribuído sob a licença MIT. Veja o arquivo LICENSE.

As silhuetas dos modelos SVG derivam de fonte em domínio público (CC0); detalhes em app/anatomapa/assets/ATTRIBUTION.txt.

Créditos

  • Pedro Rosa: programador/criador
  • Marcelo Reis: Professor do Programa de Pós-Graduação em Análise de Sistemas Ambientais, CESMAC
  • Mozart Melo: coordenador/orientador, CESMAC
  • Centro Universitário CESMAC: instituição

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Metadata

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Table of built distributions (wheels) for anatomapa 0.3.4
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anatomapa-0.3.4-py3-none-any.whl Python 3 none any Details

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b1695ca4cf7a0144b8f1f3e804bf4826d808a580b1a73480a1cecda6392302f3
BLAKE2b-256 checksum
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