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anatomapa

anatomapa

Pinte o corpo humano com os seus dados.
De um dicionário ou de uma planilha a um mapa de calor anatômico em SVG, pronto pra publicar, em poucas linhas de Python e com zero dependências.

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PyPI Python 3.10+ License MIT zero dependencies

Mapa de calor anatômico masculino e feminino, com legenda


Sobre

anatomapa é uma biblioteca Python para gerar mapas de calor anatômicos da superfície externa do corpo humano. Você entrega dados quantitativos por região (frequência, intensidade ou densidade de eventos) e a lib devolve o corpo colorido, de frente e de costas, masculino ou feminino, com a cor proporcional ao valor de cada região.

Serve pra qualquer área que registra a região corporal como variável: acidentes com animais peçonhentos, traumas ocupacionais, lesões esportivas, medicina forense, queimaduras e dermatologia.

  • Zero dependências: só a stdlib do Python no núcleo; PNG/JPG é um extra opcional.
  • Determinística: a mesma entrada gera exatamente o mesmo SVG.
  • Bilíngue: entende nomes de região em PT-BR e EN e escreve rótulos nos dois idiomas.

Instalação

pip install anatomapa

Requer Python 3.10+ e nenhuma dependência externa. Para gerar PNG/JPG/JPEG (saída raster), instale o extra opcional, que traz cairosvg e Pillow; o SVG puro não precisa disso. As aspas importam, shells como zsh e fish tratam os colchetes como glob:

pip install "anatomapa[raster]"

Para desenvolvimento, clone o repositório: git clone https://github.com/pedrorcruzz/anatomapa.git

Início rápido

import anatomapa as am

fig = am.heatmap({"hand": 5153, "foot": 13666, "face": 845})
fig.save("mapa.svg")

Pronto: um SVG com mãos, pés e face coloridos por valor. O resto deste manual é opcional.

Parâmetros de heatmap()

am.heatmap(values, view="anterior", body="male", lang="pt", format="svg",
           title=None, background="transparent", on_unknown="error",
           region_map=None, split=False)
Parâmetro Valores Padrão O que faz
values dict {região: valor} ou pares (região, valor) obrigatório Dados; chave pode ser Region; aceita a saída dos leitores
view "anterior", "posterior", "both" "anterior" Frente, costas, ou as duas lado a lado com uma legenda só
body "male", "female" "male" Corpo masculino ou feminino
lang "pt", "en" "pt" Idioma dos rótulos escritos no SVG
format "svg", "png", "jpg", "jpeg" "svg" Padrão quando o caminho salvo não tem extensão; png/jpg/jpeg pedem o extra raster
title str ou None None Opcional: só desenha o título se for informado
background "dark", "light", "transparent" "transparent" Fundo da figura
on_unknown "error", "skip", "warn" "error" O que fazer com nome não reconhecido
region_map dict {seu rótulo: id da região} None De-para de nomes seus; tem precedência
split True, False False Só com view="both": True devolve o par (frente, costas)

split só vale com view="both": True devolve o par (anterior, posterior) de figuras independentes, com a mesma escala de cor. Com outra view, levanta ValueError.

Retorna um objeto Figure. Nome de região desconhecido levanta ResolutionError (exceção pública da lib). A paleta de cores é sempre a térmica (azul frio para laranja quente, visual de câmera térmica); não há escolha de paleta. A escala de intensidade é sempre linear: a cor cresce proporcional ao valor.

Fundo e título

  • background: "dark" (#0a0a0a), "light" (#ffffff) ou "transparent" (padrão). As cores da legenda se adaptam ao fundo escolhido.
  • title: quando informado, sai em negrito, centralizado em relação ao corpo, acima do desenho; título longo encolhe a fonte para caber e o texto segue também como <title> do SVG. Com split=True, cada figura recebe o título.

A legenda (barra de valores mín..máx, rótulo conforme lang) e o degradê térmico sobre o corpo são nativos: sempre presentes, sem parâmetro. A escala da legenda conta só valor que realmente pinta (agregador coberto pelos filhos não entra), e os marcadores ganham casas decimais quando arredondar para inteiro repetiria dois deles.

Nomes de região

A identificação é estrita: vale o id da região escrito exatamente como definido, ou uma chave do seu region_map. Nada é adivinhado, então não existe uma segunda grafia certa para a mesma região. Nome desconhecido levanta ResolutionError, listando o que falhou e sugerindo o mais parecido. Controle com on_unknown: "error" (padrão), "skip" ou "warn".

No código: o enum Region. from anatomapa import Region traz 94 constantes: os 32 ids canônicos mais as versões _LEFT/_RIGHT das 31 bilaterais. Cada membro é a própria string do id (Region.HAND == "hand"), então vale como chave de heatmap() ou valor de region_map. O ganho é autocomplete e typo virando erro imediato. list(Region) ou list_regions() listam.

Lateralidade. Todas as regiões são bilaterais, menos genital, que é central. As bilaterais aceitam lado pelo sufixo do id: Region.HAND_RIGHT pinta só a direita; sem sufixo (Region.HAND), pinta os dois lados. O lado segue a convenção do observador (esquerda da imagem), não a anatômica. Pedir lado em região central é erro.

Seus nomes vindos da planilha: region_map. Como os rótulos da sua fonte quase nunca batem com os ids, é você quem declara a correspondência, uma vez, no código. A chave é comparada exatamente como está na planilha, incluindo acento e caixa alta:

am.heatmap(dados, region_map={"MÃO": Region.HAND, "ANTE-BRAÇO": Region.FOREARM})

Regiões e hierarquia

São 32 regiões numa árvore de até 3 níveis. Região agregadora não tem desenho próprio: um valor nela desce para os filhos. Entre parênteses, a vista onde a região desenha:

head           Cabeça (agregadora)
├─ face            Face (frente)
├─ skull           Crânio (costas)
└─ neck            Pescoço (frente e costas)
trunk          Tronco (agregadora)
├─ shoulder        Ombro (frente e costas)
├─ chest           Peito (agregadora)
│  ├─ upper_chest      Peito superior (frente)
│  └─ lower_chest      Peito inferior (frente)
├─ abdomen         Abdômen (agregadora)
│  ├─ upper_abdomen    Abdômen superior (frente)
│  └─ lower_abdomen    Abdômen inferior (frente)
├─ back            Costas (agregadora)
│  ├─ upper_back       Dorso (costas)
│  └─ lower_back       Região lombar (costas)
└─ genital         Região genital (frente; a única central)
arm            Membro superior (agregadora)
├─ upper_arm       Braço (frente e costas)
├─ elbow           Cotovelo (frente e costas)
├─ forearm         Antebraço (frente e costas)
├─ wrist           Punho (frente e costas)
└─ hand            Mão (frente e costas)
   └─ finger           Dedos da mão (frente e costas)
leg            Membro inferior (agregadora)
├─ hip             Quadril (frente)
├─ buttocks        Nádegas (costas)
├─ thigh           Coxa (frente e costas)
├─ knee            Joelho (frente e costas)
├─ lower_leg       Perna (frente e costas)
├─ ankle           Tornozelo (frente e costas)
└─ foot            Pé (frente e costas)
   └─ toe              Dedos do pé (frente e costas)

Herança (rollup), consciente de lado. Mande o dado no nível que você tiver. Para pintar cada região, a lib sobe pela árvore e usa o primeiro ancestral com valor. Três regras:

  1. Sobe até achar um valor e para no primeiro.
  2. Em cada degrau, o lado explícito vence o geral (foot_left antes de foot).
  3. Região mais funda vence ancestral mais raso: em {"leg_left": 10, "foot": 2}, o pé esquerdo vale 2, não 10.

O caso real de perícia é descrever um lado no geral e o outro em detalhe:

am.heatmap({
    Region.LEG_RIGHT: 8,       # membro inferior direito inteiro
    Region.THIGH_LEFT: 2,      # esquerdo detalhado segmento a segmento
    Region.LOWER_LEG_LEFT: 9,
    Region.FOOT_LEFT: 4,
})

À direita, tudo de hip a foot sai em 8. À esquerda pinta só o declarado, mais toe_left herdando 4 do pé; hip_left e buttocks_left ficam sem valor e não pintam. Quem detalha assume a responsabilidade de cobrir tudo que quer pintar.

Migrando da 0.3 (quebras). leg e arm mudaram de significado: leg era a panturrilha (agora lower_leg) e arm era o braço acima do cotovelo (agora upper_arm); hoje são os membros inteiros. Como o código antigo continua rodando e pinta outra coisa, usar leg ou arm emite DeprecationWarning apontando a sua linha e o id novo. pelvis deixou de existir: virou hip, filho de leg. buttocks também mudou para leg, então valor em trunk não pinta mais as nádegas. chest, abdomen e back seguem válidos, mas viraram agregadores.

Região sem dado. Região sem valor sai nativamente em cinza neutro (#9aa0a6), distinto do frio: "sem dado" não se confunde com "poucos casos". Sem parâmetro.

Entrada de dados

heatmap() aceita dict ou qualquer iterável de pares (região, valor), então a saída de todos os leitores vai direto, sem conversão:

# dict puro (ou normalizado via from_dict)
fig = am.heatmap(am.from_dict({"hand": 10, "foot": 25}))
# CSV: você declara as colunas, nada é adivinhado
dados = am.from_csv("lesoes.csv", region_col="regiao", value_col="total", delimiter=",")
# JSON: objeto {"hand": 10} ou lista [{"region": "...", "value": ...}]
dados = am.from_json("lesoes.json", region_key="region", value_key="value")
# Registros: dicts, namedtuples, dataclasses e DataFrame do pandas (duck typing)
dados = am.from_records(registros, region_col="regiao", value_col="total")
# Excel .xlsx, sem dependência externa; coluna por índice, letra "D" ou nome do cabeçalho
dados = am.from_xlsx("lesoes.xlsx", sheet="2024", region_col="Região",
                     value_col="Total", header=True)

No from_xlsx, aggregate resolve planilhas com uma linha por caso: "count" conta as ocorrências de cada região e "sum" soma os valores. None (padrão) espera uma linha por região.

Saída: o objeto Figure

Uso Resultado
fig.save("mapa.svg") grava o arquivo; a extensão do caminho (.svg, .png, .jpg) decide o formato, fig.save(caminho, format="png") força outro e, sem extensão, vale o format do heatmap
fig.to_svg() devolve o SVG como str
fig.to_png() devolve o PNG como bytes (pede anatomapa[raster])
fig.to_jpeg() devolve o JPEG como bytes (pede anatomapa[raster])
str(fig) idem to_svg(), SVG puro (útil em templates)
célula do Jupyter renderiza inline automaticamente

Pra saída raster (PNG/JPG/JPEG), instale o extra pip install anatomapa[raster] (cairosvg e Pillow, importados só sob demanda; o núcleo segue zero dependências). Qualquer figura rasteriza com as mesmas cores e o mesmo visual térmico do SVG. Sem o extra instalado, pedir png/jpg/jpeg levanta ImportError com a dica de instalação.

Utilidades

validate(values, body="male", region_map=None) faz o dry-run: não renderiza, só mostra o que resolve e o que não.

am.validate({"hand": 1, "haand": 2, "hand_right": 3})
# {'resolved': {'hand': 'hand', 'hand_right': 'hand_right'},
#  'unresolved': {'haand': {'reason': 'região desconhecida',
#                           'suggestions': ['hand', 'head', 'hand_left']}}}

list_regions(lang="pt", body="male", view=None) lista as regiões, cada uma como {"id", "label", "bilateral", "parent", "views"}. Com view, filtra por vista (agregadoras, de views vazio, sempre aparecem):

am.list_regions(view="posterior")
# [{'id': 'head', ..., 'views': []}, {'id': 'skull', ..., 'views': ['posterior']}, ...]

Galeria

Mesmo mapa em fundo escuro, claro e transparente, masculino e feminino Modelo anatômico masculino e feminino

Licença e atribuição

Distribuído sob a licença MIT. Veja o arquivo LICENSE.

As silhuetas dos modelos SVG derivam de fonte em domínio público (CC0); detalhes em app/anatomapa/assets/ATTRIBUTION.txt.

Créditos

  • Pedro Rosa: programador/criador
  • Marcelo Reis: Professor do Programa de Pós-Graduação em Análise de Sistemas Ambientais, CESMAC
  • Mozart Melo: coordenador/orientador, CESMAC
  • Centro Universitário CESMAC: instituição

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Metadata

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